食品加工廢水富含糖類、蛋白質等易降解有機物，COD 濃度通常在 2000-8000mg/L，且水質波動大，采用厭氧發酵反應器與好氧曝氣池組合工藝可實現處理，其運行參數優化直接影響處理效能與成本控制。
厭氧發酵階段需重點控制三個參數：溫度維持在 35±2℃的中溫環境，確保產甲烷菌活性；水力停留時間（HRT）根據廢水濃度調整，高濃度廢水（COD＞5000mg/L）設為 12-15 天，低濃度廢水（COD＜3000mg/L）縮短至 8-10 天；pH 值穩定在 6.8-7.2，通過投加碳酸氫鈉調節酸堿平衡。優化后，厭氧階段 COD 去除率可達 70%-80%，同時產生沼氣實現能源回收。
厭氧出水進入好氧曝氣池，關鍵參數包括：溶解氧（DO）控制在 2-3mg/L，采用鼓風曝氣方式，曝氣強度 1.5-2.0m3/(m2?h)；污泥濃度（MLSS）維持在 3000-4000mg/L，污泥齡（SRT）設為 15-20 天，避免污泥老化。某果汁加工廠通過參數優化，好氧階段 COD 去除率提升至 90% 以上，終出水 COD≤100mg/L，滿足《污水綜合排放標準》（GB 8978-1996）一級標準，且噸水運行成本降低 12%。