一個單位是否選擇“代理記賬”取決于該單位是否具備配備專職會計人員的條件，這應該由各單位根據自身會計業務的需要自主決定。一般而言，單位規模的大小、經濟業務和財務收支的繁簡程度、經營管理的要求等，是決定單位是否配備專職會計人員的主要因素。單位規模大、經濟業務多、財務收支量大、在經營管理上要求高的單位，一般應該單獨設置會計機構并配備專職的會計人員，以便及時組織本單位各項經濟活動和財務收支的核算，實行有效的會計監督，以保證會計工作的效率和會計信息的質量。
1、 有些代理記賬公司沒有與委托單位簽訂正式的委托代理合同，對雙方的權利、義務缺少明確的規定，在實際工作中遇到異議時，往往無法分清責任。因此在選擇代賬公司的時候，企業就要更加謹慎。
2、個別 “代理記賬公司”沒有代理記賬資質（市財政局批準的代理記賬許可證、會計上崗證等），發生問題可以回避責任，損害委托單位的利益。這也是小企業在選擇代賬服務公司時必須要注意的事項。
3、 財務軟件需要到財政局備案方可使用，有的代理記賬單位沒有采用財政部批準的財務軟件來替代手工記賬。
4、 會計資料交接麻煩、不夠規范。代理記賬單位在接受委托單位的會計原始憑證及資料時，沒有辦理交接手續，發現遺失或毀損時無法查找。
5、代理記賬單位通常是定期或定時上門服務，日常業務可通過電話溝通，會計不是隨時在單位辦理和咨詢業務
代理記賬機構及其從業人員的義務：
（1）按照委托合同辦理代理記賬業務，遵守有關法律、行政法規和國家統一的會計制度的規定；
（2）對在執行業務中知悉的商業秘密應當保密；
（3）對委托人示意其作出不當的會計處理，提供不實的會計資料，以及其他不符合法律、行政法規和國家統一的會計制度規定的要求，應當拒絕；
（4）對委托人提出的有關會計處理原則問題應當予以解釋。
費用類發票處理 做好內部單據報銷制度，規定報銷時間，及時收集公司員工手中的費用，單據，將其歸類入賬。認真查看費用單據是否合法，未取得合法憑據的費用是無法得到稅務機關的認可的。平時還應做好費用入賬金額控制，對類似招待費、廣告費等存在抵扣限額規定的費用科目，應及時核對發生金額，對超過抵扣標準的費用應減少其入賬金額。
