北京大學腫瘤醫院胃腸腫瘤中心二病區擁有的胃腸腫瘤診療和研究團隊，比肩國際胃腸診療中心。共開放床位29張，專長于進展期胃腸腫瘤的手術和綜合、早期胃癌的保留功能手術、低位直腸保肛手術等。主治病種包括胃癌、結直腸癌、胃腸道間質瘤和其他少見胃腸道腫瘤。在多學科討論的基礎上，為每一位患者制定和實施為合理的診療規劃。在中心主任季加孚院長的直接領導下，科室秉承北京大學腫瘤醫院的優良傳統，追求，不斷進步，在臨床、科研、教學等各方面均取得了令人欣喜的成果，保持穩健、嚴謹工作作風的同時，走上了高速發展的快車道。科室人員結構：1、人員構成：主任醫師3人，副主任醫師6人，主治醫師7人，住院醫師2人，護理人員17人。2. 科室主要領導：胃腸腫瘤中心主任季加孚，科主任步召德，護士長趙旻。
科室特色包括：微創手術、外科、疑難手術、功能保留手術、快速康復、病人全程管理。
北京大學腫瘤醫院肝膽胰外一科創建于1996年。現有病床33張，醫師10人，其中正高職稱醫生2人，副高職稱1人，中級職稱4人，在讀研究生4人，所有醫生均為研究生畢業。建科以來，在黃信孚及邢寶才主任的領導下，科室全體醫師秉承以"延長病人生存，改善病人生活質量，為病人解除病痛"為目標，把肝膽胰腫瘤綜合的理念與肝膽胰外科手術的近技術相結合，不斷創新，不斷提高，不斷完善，形成了鮮明的本科室的診療特色。在醫療、科研和教學方面居國內水平。同時，培養出了一大批研究生和青年醫師。
現任主任邢寶才，教授，主任醫師。擔任：中國協會肝癌專業委員會常委，中華外科學會肝臟外科學組委員，中華腫瘤學會肝癌學組委員，中國協會大腸癌肝轉移學組委員，中國協會膽道腫瘤委員會常委，中國協會胰腺癌委員會委員，衛生部腫瘤規范化專家委員會委員，北京協會理事，北京協會肝膽胰腫瘤委員會主任委員，北京腫瘤學會委員，北京大學肝癌中心副主任，北方肝癌專家委員會副主任。同時擔任多種雜志的編委和審稿專家。
腫瘤婦科現有床位32張，醫護人員20人，其中副主任醫師以上醫師3人，承擔著醫療、教學和科研工作。
主要診治婦科各種良、惡性腫瘤，包括卵巢、子宮體、宮頸、陰道和外陰的良惡性腫瘤等。開展全子宮切術、附件切除術、子宮廣泛性切除及次廣泛切除術、卵巢癌減瘤術、陰式子宮切除術、宮腔鏡、腹腔鏡手術及LEEP刀宮頸錐切術。以婦科腫瘤的綜合為特色，強調個體化綜合方案，擅長難治性或復發婦科惡性腫瘤的。主要特色包括：
1. 擅長難治性或復發婦科惡性腫瘤的。依據患者病情，合理地應用手術、化療、放療、介入和生物等手段，制定個體化方案，延長患者的生存期，提高患者的生活質量。
2. 順應微創外科的潮流，積極開展微創手術，包括腹腔鏡下廣泛子宮切除、盆腔淋巴結清掃術、宮腔鏡下腫瘤切除術、宮頸LEEP刀錐切術、子宮內膜熱球、陰式子宮切除術等。在保證效果的同時，減輕患者的痛苦，縮短術后恢復時間。
3. 與腫瘤內、外科專業組密切合作，對消化道惡性腫瘤的卵巢轉移以及乳腺癌內分泌后的婦科問題采取有力的措施進行，取得了一定的效果。
腫瘤婦科的全體醫護人員繼承老一代艱苦創業、科學求實的學風，堅持以病人為中心，規范醫療行為，保障醫療，降低醫療費用，提高醫療質量，以高水平的醫療技術和體貼周到的服務，讓患者得到滿意的效果。
北京大學腫瘤醫院介入科創建于1996年，是一個獨立的、有鮮明特色的臨床科室。目前介入病房有34張床位，醫師13人，其中正高職稱醫生2人，副高職稱5人，中級職稱4人，住院醫師3人，在讀研究生4人。科室配備了GE大平板血管造影系統(4100IQ)，具有大視野DSA功能、三維血管成像和CBCT成像功能，三維血管容積成像使經血管的腫瘤介入準確性和性明顯提高，同時完成的CT斷層重建使經皮穿刺介入功能進一步完善。目前正在安裝配置國際Siemens Miyabi Angio-CT系統，該系統具有滑動64層螺旋CT功能和大平板數字化減影功能，并實現CT和DSA的真正融合，是現代影像學引導介入的典范，推動該科的介入達到國際先進水平。
