據(jù)醫(yī)院官網(wǎng)2015年12月信息顯示，醫(yī)院設(shè)置165個(gè)臨床、醫(yī)技科室，233個(gè)護(hù)理單元，擁有8個(gè)國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科、1個(gè)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、20個(gè)省部級(jí)及全軍重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、33個(gè)全軍醫(yī)學(xué)專科中心和研究所，形成了以綜合診療為特色的13項(xiàng)專業(yè)優(yōu)勢(shì)。同時(shí)是全軍重癥監(jiān)護(hù)示范基地和中華護(hù)理學(xué)會(huì)的培訓(xùn)基地。設(shè)有國(guó)際醫(yī)學(xué)中心和健康醫(yī)學(xué)中心，提供高端預(yù)防保健服務(wù)。醫(yī)院年門急診量490余萬人，收容19.8萬人，手術(shù)近9萬例。
2019年7月由科技部、國(guó)家衛(wèi)生健康委、軍委后勤保障部和原食品藥品監(jiān)管總局正式批準(zhǔn)依托解放軍總醫(yī)院第五醫(yī)學(xué)中心成立國(guó)家感染性疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心。研究中心整合國(guó)內(nèi)79家協(xié)作醫(yī)院，針對(duì)慢性乙肝、慢性丙肝、艾滋病及其相關(guān)疾病等病種，建立病程涵蓋臨床各個(gè)階段的大隊(duì)列，同時(shí)建立標(biāo)準(zhǔn)化的生物樣本庫、臨床診療信息庫及的疾病發(fā)病追蹤系統(tǒng)，形成涵蓋重大感染性疾病及各個(gè)病程的資源平臺(tái)，終建立我國(guó)規(guī)范的病毒性肝炎、艾滋病臨床大數(shù)據(jù)及生物樣本庫整合平臺(tái)，形成專業(yè)的管理團(tuán)隊(duì)，為建立符合我國(guó)人群特點(diǎn)的肝病、艾滋病診療體系提供重要戰(zhàn)略性資源。
在學(xué)科帶頭人陳香美院士帶領(lǐng)下，腎臟病醫(yī)學(xué)部1993年獲批碩士學(xué)位授予點(diǎn)，1998年獲批博士學(xué)位授予點(diǎn)，1999年獲批博士后流動(dòng)站，2007年獲批集內(nèi)科學(xué)（腎病）國(guó)家重點(diǎn)學(xué)科、2008年獲批內(nèi)科學(xué)（腎病）北京市重點(diǎn)學(xué)科。是國(guó)家衛(wèi)健委、北京市住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)基地、專科醫(yī)師培訓(xùn)基地，國(guó)家衛(wèi)健委腹膜透析培訓(xùn)示范中心，全軍野戰(zhàn)內(nèi)科學(xué)教學(xué)基地，中華護(hù)理學(xué)會(huì)及北京市血液凈化專科護(hù)士培訓(xùn)基地，全軍重癥監(jiān)護(hù)專科護(hù)士培訓(xùn)基地。
堅(jiān)持臨床專科病理教學(xué)、理論授課、技能培訓(xùn)、科主任教學(xué)查房、疑難病例討論，突出腎活檢病理、血液透析、腹膜透析、CRRT等專科特色。現(xiàn)有博士生導(dǎo)師7人，碩士生導(dǎo)師13人，進(jìn)修生指導(dǎo)老師54人，指導(dǎo)“四生”教學(xué)任務(wù)，培養(yǎng)研究生（含聯(lián)合培養(yǎng)），博士后21人（6位獲得博士后基金）、博士169人、碩士233人，規(guī)培生、進(jìn)行生600余人。其中20人擔(dān)任全國(guó)三級(jí)甲等醫(yī)院的學(xué)科帶頭人，
獲得軍隊(duì)博士論文1篇、碩士論文2篇，全國(guó)百篇博士論文提名1篇。畢業(yè)的學(xué)生獲得求是杰出青年獎(jiǎng)1名、中國(guó)青年科技獎(jiǎng)2名、原總后科技新星2名、北京市科技新星6名。
作為教學(xué)示范窗口，接待到訪國(guó)內(nèi)外、軍內(nèi)外專家100余次。
