企業通過ISO9000認證體系，應該如何應用，還有在具體操作中我們應注意解決好四個方面的問題。
（一）統一思想，提高認識。認識是行動的先行導向。在具體貫徹和導入ISO9000質量管理體系的工作中，企業全體員工要更加進一步統一思想，提高認識，克服以下的幾種錯誤傾向。，認為商業企業貫標是在搞形式主義。第二，認為貫標是貫標部門的事，與單位（部門）無關的錯誤認識。第三，經常患得患失的錯誤認識。第四，認為我們相關部門的人員素質參差不齊，與ISO9000國際標準相距太遠，不如維護現狀，還是老傳統管用的錯誤思想。第五，認為貫標是對領導權力削弱的錯誤認識。
（二）加強領導，全員參與。切實導入和推行ISO9000質量管理體系，讓ISO9000質量標準在生產經營管理中得到實際應用，“一把手”作為企業的決策者和組織者，要充分發揮體系運行的導航作用，避免質量管理體系運行流于形式；要把企業宗旨、發展方向與內部環境統一起來，使員工充分參與體系的運行，實現工作目標；要把質量管理體系真正納入企業發展的重要議事日程，在人員、經費等方面給予充分保證，為貫標工作創造必要的條件。我們還要注意相應的組織指揮系統和傳導系統的建立和運作，做到決策者有思路，組織者有方案，工作者有責任，齊抓共管，務求實效。
（三）統籌兼顧、注意方法。要注重科學性和實用性。在導入ISO9000質量管理體系的過程中，我們不僅要通過宣傳、培訓、指導等形式，使企業的全體員工對質量管理體系的標準做到知之、懂之、用之,而且要利用經濟的、市場的、行政的手段和措施，認真解決好生產經營管理中的服務、督促、落實和有效監控問題。此外，我們還要認真研究和揚棄原有的一系列質量管理范疇內的好經驗、好形式、好辦法，使之與ISO9000體系的主旨和要求達到統一，得到提升。既有的放矢，用虛懷若谷的胸懷，查漏補缺，解決不符合質量要求的問題，又要實事求是，從實際出發，體現行業的特點和企業的現狀，穩步推進，積極穩妥。
（四）建立長效機制。導入ISO9000體系是一項長期的系統工程，對我們的各項管理提出了更高的要求。為保證體系的實施效果，我們必須立足長遠，圍繞體系的運作要求,對企業內部的崗位設置、人員管理、效益分配和企業運作程序進行長期規劃,建立起長久、有效的推行機制和管理機制，以加強對體系實施過程的有效控制。
同時，導入ISO9000體系應該與企業的內部管理相輔相成，互相促進。一方面作為企業整體管理的一個有機組成部分，導入ISO9000體系要和企業整體管理的目標相一致,服從和服務于企業管理大局。另一方面,企業管理要為導入ISO9000體系提供必要的條件和保障。要把各項工作具體到崗位，明確到人員，做到有標準可依，有據可查，功過分明，獎懲到位，為企業持續發展提供強勁的推動力。