水母型的體壁結構與水螅型基本相似，也是由兩層上皮肌肉細胞中間夾有中膠層構成，但水母型的中膠層遠較水螅型發達。體壁圍繞的胃循環腔也較發達，它或是一個簡單的囊，或是被膜分隔成4個胃囊，由胃囊向傘緣伸出4條（水螅綱水母）或更多的（缽水母）輻射管，并與傘緣平行的環管相連，由環管也可伸出離心的小管進入觸手，直達觸手末端。在傘緣或觸手基部有感覺器官，例如眼點或平衡囊。
大多數水母的輻管、觸手及感官均呈四輻射對稱。觸手是刺胞動物重要的結構之一，雖然某些水螅型與水母型完全缺乏觸手。觸手基本上可分為兩種形態，一種是頭狀的，短小，刺細胞集中在觸手端部，組成帽狀結構，一種是絲狀的，細長，刺細胞沿觸手全長呈環狀或瘤狀分布，這兩種觸手或單獨存在于不同的種，或同時存在。觸手的數目、結構、排列方式在不同的種不同，觸手或由于胃腔的伸入而中空，或由胃腔細胞充滿而呈實心結構。觸手的數目也常隨動物年齡的增加而增加，觸手的基部也常膨大，是感覺細胞或刺細胞集中的結果。
有些水母不單顏色多變，而且還會在水中發光，有些閃耀著微弱的淡綠色或藍紫色光芒，有的還帶有彩虹般的光暈，當它們在海中游動時，就變成了一個光彩奪目的彩球。水母發光靠的是一種叫埃奎明的奇妙的蛋白質，這種蛋白質和鈣離子混合時，就會發出強藍光。埃奎明的量在水母體內越多，發的光就越強，每只水母平均只含有50微克。
缽水母類傘緣的4個或8個觸手囊也是它的神經感覺中心，它具有感光、重力感受及化學感受的功能。觸手囊是由環管向外延伸形成一個中空的小盲管，其末端具有內胚層分泌的鈣質顆粒，稱平衡石（statolith）。外傘緣在平衡囊上端延伸形成笠（hood），用以保護及遮蓋下面的平衡囊，其兩側有感覺瓣（sensorylappets），其上有感覺細胞及纖毛。當身體傾斜時，端部的結石與感覺纖毛受到刺激而引起運動以調節身體的平衡。