擔保公司保函的取得較為容易，費用也較低，但由于其本質為商業信用擔保，所以公信力較低。另外，公司保函大多有很強烈的地域特色，某一地區被承認的擔保公司多是由當地相關部門如建委等批準，因而其出具的保函也只在本地區內被承認。
銀行保函，由于其出具方的專業金融性質和實質擔保的能力更強以及其銀行信用等特點，因而公信力較擔保公司出具的保函更強。所以，許多大型的工程招標過程中，甲方會指定要求乙方出據銀行保函而非擔保公司保函。與之相對應的是，銀行保函的取得過程相對公司保函而言要求更為嚴格，最基本的要求是被保證方必須在保證銀行方有足夠的授信額度，如果沒有授信額度則需要有不低于被保額度的存款準備，并且該存款在保函有效期內不可被動用。
目前國內銀行保函大多用擔保公司在銀行授信開出，能開銀行履約保函的，基本上只有建行，平安，光大等。部分招標文件要求開到基本戶，涉及到銀行保函的轉開，只能建行操作。
通過擔保公司辦理銀行保函不需要存全額保證金，只需要繳納很低一部分費用即可。銀行保函辦理周期更長，費用相對更高。擔保公司保函出函速度更快，費用低，辦理靈活。
銀行保函： 1. 銀行保函又稱保證書，是指銀行、保險公司、擔保公司或擔保人應申請人的請求，向受益人開立的一種書面信用擔保憑證，保證在申請人未能按雙方協議履行其責任或義務時，由擔保人代其履行一定金額、一定時限范圍內的某種支付或經濟賠償責任； 2. 現階段最常用的銀行保函為：投標保函、履約保函、支付保函、預付款保函。 履約保函： 1. 履約保函 Performance Guarantee，指應勞務方和承包方（申請人）的請求，銀行金融機構向工程的業主方（受益人）做出的一種履約保證承諾； 2. 如果勞務方和承包方日后未能按時、按質、按量完成其所承建的工程，則銀行將向業主方支付一筆約占合約金額5%~10%的款項； 3. 履約保函有一定的格式限制，也有一定的條件。 商業保函： 商業保函是指除銀行以外有信譽的，實力雄厚的商業機構出具的保函。
商業保函（又稱擔保公司保函）是由具有雄厚實力、完善風險體系、良好信譽的專業工程擔保公司開立的保函，與銀行保函保證的內容和承擔的責任一致。
按照開出主體不同，一般分為商業保函和銀行保函。銀泰工程擔保可以辦理商業保函以及銀行保函。擔保公司保函和銀行保函主要區別有：
1、銀行保函是銀行信用，商業保函是商業信用。
2、銀商業保函多用于國際貿易，用于國際擔保業務。而商業保函多用于國內公司。
3、商業保函對比銀行保函資料簡單，辦理速度快，費用更低。
4、商業保函格式條款等更加靈活，銀行保函格式相對固定不易修改。
5、商業保函可以修改保函開具日期，銀行保函不接受修改。
銀行保函對企業資質要求高，三級資質履約保函、純采購項目履約保函、民工工資保函、質量保修保函，銀行在出具銀行保函過程中，要求繳納保證金。商業保函和銀行保函起到的法律效力相同，相同條件下，辦理商業保函費用便宜，更加快捷靈活。
商業保函：商業保理是一整套基于保理商和供應商之間所簽訂的保理合同的金融方案。
商業保理合同是指不論是否出于融資目的，供應商為實現應收賬款分戶管理、賬款催收、防范壞賬中的一項或多項功能，將已經或即將形成的應收賬款（以下簡稱“應收賬款”，根據上下文也可能指部分應收賬款）轉讓給保理商的合同。
我國商業保理行業發展現狀分析 商業保理發展規模 中投顧問在《2016-2020年中國商業保理行業深度調研及投資前景預測報告》中指出，我國新增商業保理公司數量、保理業務量和融資余額等主要指標連續多年保持成倍增長態勢。 截至2015年12月底，全國共有注冊的商業保理企業2514家，其中2015年新設立的商業保理公司1294家，新增企業數量是2014年的1.44倍。2015我國商業保理融資業務量超過2000億元，較2014年增長了1.5倍。按照總體開業比例20% 計算，500余家已經開業的商保理公司2015年大約服務了31500家中小企業，平均每家中小企業客戶獲得保理融資額為635萬元，商業保理正在成為中小企融資的重要渠道之一。