高新企業認定需要提供多種資料和證明，其中審計報告是重中之重，因為審計報告可以推測出企業的研發能力和市場前景，那接下來就著重講一下專項審計的內容和難點！
一、專項審計定義：
高新企業認定專項審計是指注冊會計師接受擬將申請高新申報的企業委托，對其近三個會計年度（實際經營不滿三年的按實際經營年限）的研究開發費用和近一個會計年度的高新技術產品（服務）收入進行審計。
二、高新企業認定兩大主要專審：
1、高新收入專項審計，這個審計主要是審查企業的高新收入，也就是高新技術產品（服務）創造的收入占公司的總收入的比例是否達到60%以上，也就是高新企業認定規定的要求；
2、研發支出的專項審計，也就是企業的研發投入支出要占到銷售收入的一定比例，這個要根據企業的銷售收入的規模從3%-5%不等而定。
這兩個指標都是企業申請高新技術企業的硬指標，因此這兩個專項審計報告須得具備且要符合條件且合理。
三、高新企業認定專項審計難點：
1、對于研發投入應重點關注研發支出、管理費用、原材料購入明細賬、發出、結存明細表、相關費用分配表等，確認其結轉研發費用額合理性及金額的準確性。
2、高度關注折舊費用與長期待攤費用攤銷項目，屬于研究開發項目和非研究開發項目共用的資產，在進行審計時要注意檢查折舊或攤銷的分配方法的合理性，保持前后各期分配的依據一致和正確。（高新申報的痛點難點怎么解決，來咨詢：）
3、高度關注設計費用的付款申請審批單據，確認其費用發生的真實性及金額的準確性，委托設計費需關注協議等。
4、企業要關注委托外部研究開發投入項目，檢查研究開發項目中委托外部研究開發的投入額是否按80%計入研究開發費用總額，若超過80％應提請申報企業調整，保證符合高新企業申報的規定要求。